代谢组的研究方法(代谢组学研究主要内容)



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1.代谢组学的研究方法类似于蛋白质的研究方法,通常有两种方法。

2.一种方法称为代谢组学指纹图谱,使用液相色谱-质谱(LC-MS)来比较不同血液样本中的代谢物,以确定所有的代谢物。

3.代谢指纹分析本质上是通过比较不同个体中代谢产物的质谱峰,最终了解不同化合物的结构,建立一套完整的分析方法来鉴别这些不同化合物的特征。

4.另一种方法是代谢组学分析,研究人员假设一种特定的代谢途径并进行进一步研究。

5.对于代谢物,不仅有质谱峰的特征。

6.再者,质谱不能检测所有的代谢物,不是因为质谱的灵敏度不够,而是因为质谱只能检测离子化的物质,而有些代谢物在质谱中是无法离子化的..

7.核磁共振法可以弥补色谱法的不足。

8.剑桥大学的朱尔斯·格里芬(Jules Griffin)博士试图通过质谱和核磁共振相结合,建立一个完整的体内代谢路径图。

9.格里芬使用核磁共振来检测高丰度的代谢物。由于核磁共振检测的灵敏度不高,只用于分析低丰度的代谢物。

10.以前核磁共振只用于毒理研究,质谱只用于植物代谢研究。

11.目前,这两种方法已被广泛应用于代谢组学研究。

12.为了在不同样本之间进行有意义的比较,研究人员必须将这两种方法获得的大量数据结合起来进行分析。

13.此外,还需要结合基因组学研究获得的数据。

14.Gary Siuzdak博士在美国Klip研究所(TSRI)从事生物信息学研究。他设计了一个实验方案,分析不同样本的代谢物变化。

15.研究人员可以通过生物信息学软件XEMS比较不同的数据来识别代谢物。

16.该软件提供了所有代谢物的分子量数据,这些代谢物的浓度因不同个体而异。

17.公众可以从网上免费获得这些数据。

18.Siuzdak博士表示,他们正在使用综合研究方法进行代谢组学研究,试图检测尽可能多的代谢物,这超出了过去人们所能达到的目标。

19.通过个体研究,希望能在一定程度上识别出与应激相关的新分子。这些应激源可能是疾病、敲除酶或其他物质。