公司已经签了第三方协议，请问是不是在地税网上申报系统里面申报，
银行直接扣款就行了？
安装了税控制系统的，就可以通过网上申报，交税款，那要看是否和税务局签订划税协议，如果没签订，那就从开户行划款，如果签订了，则直接从约定的银行划款。
补充：网上报税操作流程简述
网上报税操作流程分为以下几步：
（第一步）填写申报表
纳税人利用“填写申报表”功能填写需申报的申报表（没有在地税部门做过税种登记的税种，网上不能申报）；分主附表的，先填写附表并保存，然后打开主表进行编辑或直接保存，如：营业税申报。
（第二步）正式申报
纳税人利用“正式申报”功能将已填写并保存过的申报表正式申报到地税征管系统。申报表正式申报成功后，不能再进行填写和修改。未正式申报或正式申报失败的申报表，其包含的税种按未申报对待。
（第三步）网上划款
纳税人利用“网上划款”功能对正式申报成功的申报表，通过划款功能生成待划款税票，若提示划款失败，应返回继续进行划款操作。（地腊简碰税部门会将待划款税票的信息定期传递到银行进行扣款轮谈）。纳税人可在成功划款一日后通过“网上划款”功能的实缴查询，确认地税部门扣款咐橡是否成功。
（第四步）申报查询、划款查询
正式申报及网上划款结束后应利用“申报查询”、“划款查询”进行申报查询、划款查询。确保需要申报的申报表都已经申报、划款成功。
（第五步）打印申报表和完税证明。
正式申报成功后，可以通过“申报查询”功能打印出申报表（纸张为A4纸）。
扣款成功后，可以到开户银行打印完税凭证。
注：登录“纳税人识别号”为您的税务登记证号，“密码”为您的网上报税银行账号的后6位。为保证您网上报税数据的安全，建议您在第一次登录网上报税系统后立即修改初始密码，并在以后定期修改密码。
1、如果灶李是企业端报税软件，在申报纳税之竖辩腔后直接就可以网上划余衫款的，
2、如果是在地税办税平台上报税，需要在办税平台上申报纳税之后划款的
问度娘，或去地税局。
地税要看是哪个省的，不同省报税网址不一样