同时使用手工凭证与财务软件，若手工凭证上的序号是2开始，而软件是1开始，每张都差一位，可以修改手工吗

因为是按财务软件系统为准，可否直接修改手工凭证上的序号，然后盖章？

不可以在另一张改把原始的留一起

没有必要修改。你现在是手工记账和软件做账并行，目的无非是看下账务准确性以及熟悉财务软件的过程余渗，枣衫最终都会以其中1套为准。所以2套没有必要连号都一致。金额对上就可凳毁腔以了。