分部分项工程量清单综合单价计价表中的数量是怎么来的？它和清单工程量、定额工程量有什么联系吗？

并且材料费明细数量怎么来的？怎么和定额里的消耗不一样？

你说的应该是综合此纯单价分析表吧。这个数量是基本单位，不是定额单位缓扒颂。如果显示不是和定额对应的基本单位，那么一定是人为干扰调整了定额工程量，（即定额工程量扰郑和清单工程量不一致），从这点也可以看出是否有人捣鬼。至于你说的人材机含量，那是定额规定的，你不用管它。